- 224 кантаты;
- 7 мотетов;
- 14 литургических произведений;
- 11 пассион и ораторий;
- 2 светские кантаты;
- 189 хоралов;
- 74 песен и арий;
- Кводлибет;
- 7 трио-сонат для органа;
- Прелюдии и фуги, токкаты и фуги, фантазии и фуги для органа - около 50;
- Пассакалья и фуга до минор для органа;
- 9 трио и других произведений для органа;
- 8 концертов для органа;
- Около двух сот хоральных прелюдий для органа;
- 7 партит и хоральных вариаций для органа;
- 30 двухголосных и трёхголосных инвенции для клавесина;
- 4 дуэта для клавесина из сборника Clavier-Übung III;
- 6 английских сюит для клавесина;
- 6 французских сюит для клавесина;
- 7 прочих сюит для клавесина;
- 6 клавирных партиты из сборника Clavier-Übung I;
- Французская увертюра из сборника Clavier-Übung II;
- 15 частей сюит;
- Хорошо темперированный клавир в 2-х томах;
- Прелюдии, токкаты, фантазии и фуги (около 30-ти);
- Маленькие прелюдии из Нотной тетради Вильгельма Фридемана Баха;
- 6 маленьких прелюдий;
- 5 прелюдий из коллекции Иоганна Петера Келлнера;
- 19 фуг и фугетт;
- 8 сонат;
- Итальянский концерт из сборника Clavier-Übung II;
- 16 переложений концертов других композиторов для клавира;
- 7 вариаций и другие произведений для клавира;
- 6 произведений для лютни соло;
- 6 сонат и партит для скрипки соло;
- 6 сюит для виолончели соло;
- Партита для флейты соло;
- 13 произведений для скрипки и клавира;
- 3 сонаты для виолы да гамба и клавира;
- 6 сонат для флейты и клавира;
- 5 трио-сонат;
- 6 скрипичных концертов;
- 6 бранденбургских концертов;
- 14 концертов для клавесина;
- 6 сюит для оркестра;
- 7 канонов;
- Поздние контрапунктические произведения;
а так же разные прочие произведения.
